| 発生時刻 | 震源地 | 最大震度 | 地震の規模 | 深さ |
|---|---|---|---|---|
| 2016年5月13日4:50頃 | 熊本県阿蘇 | 1 | M 2.5 | 10.0km |
| 2016年5月13日4:26頃 | 熊本県熊本 | 2 | M 2.7 | 10.0km |
| 2016年5月13日4:04頃 | 沖縄県宮古島 | 1 | M 4.2 | 30.0km |
| 2016年5月13日2:43頃 | 宮城県南部 | 2 | M 4.4 | 40.0km |
| 2016年5月13日2:25頃 | 熊本県熊本 | 2 | M 2.7 | 10.0km |
| 2016年5月13日1:03頃 | 熊本県熊本 | 4 | M 4.0 | 10.0km |
| 2016年5月12日22:56頃 | 熊本県熊本 | 3 | M 2.8 | 10.0km |
| 2016年5月12日21:12頃 | 鹿児島県薩摩 | 1 | M 4.3 | 10.0km |
| 2016年5月12日21:01頃 | 熊本県熊本 | 1 | M 2.4 | 10.0km |
| 2016年5月12日20:20頃 | 熊本県阿蘇 | 2 | M 2.9 | 10.0km |
| 2016年5月12日20:16頃 | 熊本県阿蘇 | 1 | M 2.2 | 10.0km |
| 2016年5月12日19:52頃 | 熊本県熊本 | 1 | M 2.6 | - km |
| 2016年5月12日17:27頃 | 熊本県熊本 | 2 | M 2.5 | 10.0km |
| 2016年5月12日17:04頃 | 熊本県熊本 | 4 | M 4.1 | 10.0km |
| 2016年5月12日16:33頃 | 青森県三八上北 | 1 | M 3.7 | 40.0km |
| 2016年5月12日15:32頃 | 根室地方北部 | 3 | M 4.8 | 50.0km |
| 2016年5月12日14:28頃 | 熊本県熊本 | 1 | M 2.2 | 10.0km |
| 2016年5月12日14:00頃 | 沖縄県西表島 | 1 | M 3.2 | 20.0km |
| 2016年5月12日13:30頃 | 沖縄県与那国島 | 3 | M 6.3 | 10.0km |
| 2016年5月12日13:29頃 | 熊本県熊本 | 2 | M 2.7 | - km |