| 発生時刻 | 震源地 | 最大震度 | 地震の規模 | 深さ |
|---|---|---|---|---|
| 2016年6月13日4:21頃 | 宇城市 | 1 | M 2.1 | - km |
| 2016年6月13日4:03頃 | 宇土市 | 1 | M 2.4 | 10.0km |
| 2016年6月13日2:12頃 | 標津町 | 1 | M 4.6 | 10.0km |
| 2016年6月13日0:39頃 | 熊本西区 | 1 | M 2.6 | 10.0km |
| 2016年6月13日0:00頃 | 八代市 | 2 | M 2.2 | - km |
| 2016年6月12日23:13頃 | 熊本西区 | 2 | M 2.9 | - km |
| 2016年6月12日23:08頃 | 熊本南区 | 1 | M 2.6 | 10.0km |
| 2016年6月12日22:53頃 | 八代市 | 3 | M 3.0 | 10.0km |
| 2016年6月12日22:08頃 | 八代市 | 5- | M 4.3 | 10.0km |
| 2016年6月12日21:20頃 | 熊本西区 | 1 | M 2.4 | 10.0km |
| 2016年6月12日20:31頃 | 宇土市 | 1 | M 2.2 | 10.0km |
| 2016年6月12日19:47頃 | 氷川町 | 1 | M 1.8 | - km |
| 2016年6月12日15:58頃 | 宇土市 | 1 | M 2.1 | 10.0km |
| 2016年6月12日12:49頃 | 美濃加茂市 | 1 | M 2.8 | 20.0km |
| 2016年6月12日9:21頃 | 竹富町 | 1 | M 3.7 | 30.0km |
| 2016年6月12日7:54頃 | 水戸市 | 4 | M 5.0 | 40.0km |
| 2016年6月12日7:29頃 | 長柄町 | 1 | M 3.4 | 70.0km |
| 2016年6月12日5:48頃 | 東金市 | 1 | M 3.3 | 60.0km |
| 2016年6月12日4:35頃 | 阿蘇市 | 2 | M 2.7 | 10.0km |
| 2016年6月12日3:56頃 | 山都町 | 1 | M 1.8 | - km |